Как юрлица, так и физлица оплачивают товар по окончательной стоимости - с учетом НДС.
Далее - физлица могут расслабиться, юрлица (если на основной системе налогообложения) могут вернуть принять уплаченный НДС к вычету при оплате НДС за отчетный период.
В общем, физлицам без разницы НДС