Alenka, Конечно подскажу.
Самое простое, что приходит на ум - СитиТур, автобус аля британский Даблдекер, с фиксированными остановками. Признаюсь - на обзорных экскурсиях по городу был очень давно, про что сейчас рассказывают я не знаю. Но раз это европейский формат, значит должен быть хоть какой-то уровень. Сайт -
http://www.citytourspb.ru/routes/day Цены и остановки указаны на сайте.
В октябре думаю будет уже поздно кататься по рекам и каналам на теплоходе, хотя если одеться потеплее (или сидеть на закрытой палубе), то все реально. Очень интересно и красиво, особенно летом.
Если ехать в пригороды с экскурсией, то это займет большую половину дня, особенно в выходные. Большую часть времени съест дорога. Здесь можно посмотреть варианты экскурсий:
http://excurspb.ru/bus/buspri
Пешеходные экскурсии как вариант - но тут уже как с погодой повезет.
http://excurspb.ru/walk/walkobz.html
Думаю стоит сходить в Петропавловскую крепость, даже без экскурсии, просто погулять. Если с экскурсией, то вот сюда:
http://excurspb.ru/walk/walkobz/231-petropkr.html
Вот вроде свои идеи изложил, хоть и несколько сумбурно.